La entrada a la Basílica se produce por el lado este del edificio. Le antecede el Patio de los Reyes. Su fachada principal consta de un cuerpo principal, flanqueado por dos torres, en las que resaltan los reyes de las tribus de Israel realizados por Juan Bautista Monegro. El sotocoro y el coro de seminaristas forman la antesala del templo. La basílica se organiza en tres naves. En el crucero, cuatro columnas dóricas forman el núcleo sobre el que se soporta la cúpula de 62 pies de diámetro. El lugar más significativo es el presbítero, reservado a la familia real y a los religiosos. Siguiendo la tradición paleocristiana, allí se encontraría el enterramiento del emperador. Las bóvedas de la basílica fueron pintadas por Lucas Giordano en época de Carlos II. Luca Cambiasso se encargó de representar La Gloria en el Coro y La coronación de la Virgen en la Capilla Mayor. También destacan el Crucifijo en mármol blanco a tamaño natural de Benvenuto Cellini, los cenotafios de Carlos I y Felipe II obras de Leone y Pompeio Leoni y el retablo diseñado por Juan de Herrera y realizado en mármoles por Jácome da Trezzo.
Majestuosa basílica del Real Monasterio de El Escorial, cuya entrada se produce por el Patio de los Reyes. Su fachada flanqueada por dos torres es uno de los iconos del estilo herreriano del siglo XVI.